有關靈氣的故事一直都是師生們彼此代代口耳相傳。

靈氣自然療法是由臼井甕男 (Dr. Mikao Usui) 所發現。十九世紀初，Dr. Mikao Usui 在日本京都的一所小型基督教大學任職校長，他本人也是位傳教士。在一次主日崇拜開始時，因與一位學生的互動而從此改變了他生命的焦點。

當 臼井先生正要開始舉行崇拜儀式時，一位即將畢業的高年級學生舉手請問臼井先生：「你接受聖經上記載的經文嗎？」

臼井先生回答當然接受。學生繼續問：「經上記載耶穌治癒患者及行走在水面上，你接受這些，請問你可曾親眼看過這些事？」

臼井先生回答，他相信這些記載，但也承認並沒有親眼看見這些事。學生繼續問：「對你而言，你已有自己的生活模式且很穩定，所以雖非親眼所見仍能保持信仰。但對才剛開始要踏入成人世界，心中仍存有許多疑問的我們而言，這是不夠的，我們須要的是眼見為憑。」

就這樣，一粒種子已然播下。第二天，臼井先生辭去了校長的職務，到美國芝加哥大學，也就是他獲得博士學位的學校，查閱經典，嘗試想要找出耶穌和他的門徒是如何治療病人的秘密。但他並沒有找到他想要的。

在佛教傳統中也記載佛陀有治療的能力，於是他決定返回日本，看看是否能從佛經中找到答案。當他一回到日本便開始拜訪各佛教寺院，想找到一位對這種實際治療有興趣或有這方面知識的人。終於，在一間禪寺，有一位老和尚在研究身體治療方面的知識。臼井先生 請求入寺，以便能研讀佛經，尋找治療之鑰。他得到允許之後，便開始他的研究。

在研讀所有日文佛經後仍無所穫的情況下，他開始學習中文，以便擴大他閱讀佛經的領域，即便這樣，他仍然沒有找到。於是他決定學習梵文，這樣他就可以研讀僅以梵文記載而無其他語言譯本的佛經。

在他苦心尋找七年之後，臼井先生找到他想要的，包括治療的處方、象徵（符號）及如何治療的記錄。然而他仍覺不夠。雖然他知道如何治療的知識，但卻沒有治療的力量。在跟老禪師討論這想法後，他決定上山靜坐，尋找治療的力量。老禪師警告他這樣做會有危險，因他可能會失去生命，臼井先生 說他已為此走了這麼長的一段路，他堅決上山，不再回頭。

臼井先生登上一座日本的聖山─鞍馬山，並靜坐21天。第一天他放了21塊小石頭在眼前，每過一天便丟掉一顆。當進入第21天時，他覺知到一道自天上來的光直射向他，雖然他很害怕但並沒有動，因此被光擊中倒地，就在這快速接連不斷發生事件中，他看到一個個像泡泡的光，就是他在經典中所看到的象徵〈符號〉，也就是耶穌和佛陀的治療之鑰。這些象徵〈符號〉邊燃燒邊進入他的記憶。當出神狀態結束後，他不再覺得精疲力竭與僵硬，也不再感覺到饑餓。

他起身走下山，途中因撞到石頭，腳大拇指的指甲被扯裂，他痛的跳起來並立刻用手抓住腳，幾分鐘後便不痛了，血也不流了，腳趾恢復的狀況好像剛才沒發生過撞擊的事。下山後他在一個路邊攤點早餐，賣東西的老人看著他一臉長長的鬍鬚和他身上衣服的情況，知道他已經斷食滿長一段時間了，而準備早餐需要一小段時間，所以特別告訴他這情況，以免他等得著急，並告訴臼井先生樹下有椅子，可以坐著等。

不久，老人的女兒端著早餐走來，他看著她時，發現她剛哭過，且半邊臉是紅腫的，他問她發生什麼事，她說她牙痛已三天了，他請問她是否願意讓他將手放在她臉上，經過她的允許，他將兩手像杯狀似地蓋著她的雙頰，幾分鍾後她不痛了，腫也開始消退了。

晚上他回到禪寺，有人告訴他，老禪師因關節痛正躺在床上，臼井先生先行沐浴並吃些小點後，就去看他，並再度用他的雙手解除了他的疼痛。往後的七年，臼井先生在日本一收容所行醫治病，其中有許多是可以自立謀生的年輕人，他送他們出去找工作，然而經過多年後，那些被他醫好且出去找工作的人還是回到收容所，繼續過著原來的生活，他問這些人為什麼還要回到這裡，他們說他們寧願過舊有的生活模式，臼井先生 因此了解到他是醫好了他們身體的疾病，但並沒有教他們如何用一種感恩的心過一個全新的生活。於是他離開收容所，開始教一些有心想要多了解一點的人，他教他們如何治療自己，並給他們《靈氣守則》，幫助他們也能同時治癒自己內在深層的部份。